Sorki za opóźnienie ale byłem trochę zajęty a rozłożenie się z kodem Coyote (i tak to robiłem z partyzanta, a nie przez SVN) i ogarnięcie Twojego zamysłu wymagało troszkę czasu.
Generalnie ja staram się unikać aż tak złożonych konstrukcji z display: inline oraz display-inline blok -- właśnie ze względu na trudności ze zrobieniem tego pixel-perfect na każdej przeglądarce. Prawdopodobnie na Twoim miejscu użyłbym po prostu floatów do tego typu zakładek, gdzie wszystko musi być ze sobą dokładnie spasowane.
Ale w zasadzie to... chyba jednak nie musi ;).
Tam Ci brakuje 1 piksela na dole żeby zasłonić tę szarą ramkę na dole. Ramkę zasłaniasz po prostu białym borderem. Zasłaniający border ma 2px szerokości. Zrób 3 i powinno być spoko. Nie powinno to wpłynąć negatywnie na nic, ani nawet nie powinno niczego przesunąć.
Czyli w regule ul#bar-menu-ul li.active zmień border-bottom z wartości 2px solid #fff; na 3px solid #fff.
Sprawdzałem to na Chrome i działa, a wcześniej rzeczywiście nie działało (w końcu to ten sam silnik co Safari).