Tajemnicze działanie Strumieni i poruszanie się po plikach

Witam,
Mam pytanie dot. funkcji plikowych i działania strumieni. Oto mój problem: Mam zaimplementować wyszukiwanie wzorca w pliku o wymiarach 1000x1000 i większym, różnymi algorytmami. Moje pytania są następujące:

1. Czy lepiej poruszać się po pliku funkcją seekg() i porównywać znaki czy lepiej wczytać ten plik do pamięci?
2. W jaki sposób przejść do kolejnej linii w pliku poruszając się w nim funkcją seekg (lub inna)? Po 1000 wypisanych znakach program wypisuje jakieś śmieci.
3. Kod:

 ifstream thousand;
for ( int i = 0; i < 1000; i++ )
    {
               for ( int j = 0; j < 1000; j++ )
                   {
                        thousand>>tab[i][j];  //    <--- PROBLEM
                   }
    } 

Wczytuje do pamięci plik, działa i spełnia moje oczekiwania tylko nie wiem jakim cudem. Forami poruszam się po dynamicznie zaalokowanej 2-wym tablicy znaków lecz po pliku się nie poruszam.
a)Skąd więc 'komputer' wie jaki znak chce przypisać danej komórce w tablicy?
b)Dlaczego po przypisaniu znaku danej komórce komputer wie że kolejnej komórce ma przypisać kolejny znak?
4. Po prostu dlaczego np w mojej tablicy przez to, że się nie poruszam po pliku nie mam np. cały czas pierwszego znaku?
5. Co jakbym chciał wczytać np. co drugi znak albo jakoś inaczej?

Wyciąga znak, ustawia go. robi to bo wie, że tab[i][j] to char.

gdybyś w ten sposób chciał pomijać część danych, to musiałbyś je wyciągnąć w ten sam sposób istream >> coś i to coś zostawić w spokoju.