Nieprawidłowe wypełnianie macierzy literami

Stworzyłem macierz, która ma być podstawą do przekodowywania tekstu (porównuje literki w macierzy i w tekście i jak są takie same to podmienia na indeks pola literki z macierzy). Chciałem wypełniać macierz po kolei pojedynczymi literami, ale program wypełnia całą macierz od razu tylko jedną. Dopiero zaczynam z JAVA i wszelkie rady są mile widziane.

import java.util.Arrays;
import java.util.Scanner;

class Koduj
{
	private String[][] Macierz = new String[5][5];
	
	public void setMacierz(String we)
	{
		for(int i=0; i<5;i++)
			for(int j=0; j<5; j++)
			{
				Macierz[i][j] = we;
			}
		wyswietl(Macierz);
		
	}
	
	public void wyswietl(String[][] Macierz)
	{
	    for(int i = 0; i < 5; i++) {
	        for(int j = 0; j < 5; j++) {
	          System.out.print(Macierz[i][j] + "\t");
	        }
	        System.out.println("");
	      }
	      System.out.println("");
	}
	
	public void setKey(String[][] Macierz)
	{
		int[] s = new int[2];
		
		for(int i=0; i<5;i++)
			for(int j=0; j<5; j++)
			{
				s[0] = i;
				s[1] = j;
				Macierz[i][j] = String.valueOf(s);
			}
	}
	
	public void Code(String wej)
	{
		
		
		if(wej.equals(Macierz))
		{
			setKey(Macierz);
			wej = Macierz.toString();
		}
		else
			wej = wej;
		
		System.out.println(wej);
		
	}
	
	
}


public class lab02_01  {
	
	public static void main(String[] args){
		
		int wybor;
		int x = 0;
		int y = 0;
		
		Scanner scan = new Scanner(System.in);
		String we;
		String wej = new String();
		
		Koduj k = new Koduj();
		
		System.out.println("1. wprowadzanie wartosci macierzy");
		System.out.println("2. wprowadzanie slowa");

		wybor = scan.nextInt();
		switch(wybor)
		{
		case 1:
		{
			System.out.println("wprowadz wartosci macierzy");
			for(int i = 0; i < 24; i++)
			{
				 we = scan.nextLine();
				 System.out.println(we);
				 k.setMacierz(we);
				 
			}
			
			System.out.println("2. wprowadzanie slowa");
			wybor = scan.nextInt();
		}break;
		
		case 2:
		{
			System.out.println("wprowadz slowo");
			wej = scan.nextLine();
			for(int i = 0; i < wej.length();i++)
			{
				wej.charAt(i);
				k.Code(wej);
			}
		}break;
		
		
		}
	}
	
}

Skoro chcesz mieć macierz znaków, dlaczego utworzyłeś sobie macierz ciągów znaków?

Żeby uniknąć kłopotów z typami. Na początku była ona char, ale miałem tyle różnych błędów mismatch, że wolałem, żeby macierz była tego samego typu co słowo które chcę przekodować

Od kiedy to unikanie problemów jest ich rozwiązywaniem?
Zacznij powoli - utwórz macierz znaków i spróbuj wczytać do niej ciąg znaków. Najpierw spróbuj zrobić to ręcznie na kartce kilka razy, a dopiero potem otwórz środowisko i zacznij pisać kod.

Ten sam problem, nie ważne czy char czy String

Na początek wyrzuć ten kod za okno, napisz raz jeszcze od początku, podczas pisania myśl.
Przykład głupoty kodu, jest oczywiste, że każde wywołanie tej metody

    public void setMacierz(String we)
    {
        for(int i=0; i<5;i++)
            for(int j=0; j<5; j++)
            {
                Macierz[i][j] = we;
            }
        wyswietl(Macierz);
 
    }

wypełnia całą macierz jedną wartością. Przy okazji, metoda, która zmienia wartości w macierzy nie powinna tej macierzy wyświetlać.

Ok, udało mi się rozwiązać problem z macierzą. Teraz chciałbym stworzyć funkcję która na podstawie macierzy ustawia klucz do kodowania. Napisałem coś takiego:

	public void setKey(String[][] Macierz)
	{
		int[] s1 = new int[5];
		int[] s2 = new int[5];
		
		for(int i = 0; i<5;i++)
			for(int j=0;j<5;j++)
			{
				s1[i] = i;
				s2[i] = j;
				Macierz[i][j] = String.valueOf((s1[i] + s2[j]));
			}
				
		/*for(int i=0; i<5;i++)
			for(int j=0; j<5; j++)
			{
				s[0] = i;
				s[1] = j;
				Macierz[i][j] = String.valueOf(s);
			}*/
	}

ale nie działa. Chciałbym ściągać indeksy macierzy i później podmieniać je za litery z odpowiednich komórek, np. a = 00, ale coś nie idzie. Stworzyłem dwie tablice do przechowywania indeksów, w pętli wsadzam kolejne indeksy, lecz nie sprawdza się.