Blender czy Unity3D ?

Potrzebuje zrobić animację, o obsługą myszy itd.

Co lepiej wybrać, chciałbym aby to raczej była animacja jako aplikacji.

W czym się pisze w Unity (tylko JavaScript czy słyszałem o Python) ?

Jak ciężko się w tych narzędziach odnaleść ?
Znam Jave najlepiej, co polecacie?

Zrób animację, następnie obsługę zaprogramuj w Unity3D.
Odpowiedź na pytanie jakie języki znajdziesz tutaj:
http://unity3d.com/unity/engine/programming
Java i JavaScript to dwa różne języki programowania.

Unity 3 wspiera javęscript,odmianę pythona zwaną Boo oraz C#