Zależy od projektu. jQuery zna mnóstwo osób i powstała masa pochodnych bibliotek napisanych z użyciem jQuery. Nie ma co go rzucać w kąt tylko dlatego, że jakiś hipster powiedział, że teraz to się używa react.js redux redux-saga reselect webpack... Use the right tool for the right job.
Jeżeli chodzi o moduły, to wystarczy przelecieć dokumentację.
Podkreślę tylko, że Babel jest odpowiedzialny za transpilowanie kodu (czyli w dużym uproszczeniu tylko zmienia tekst), a do pełnego działania będziesz potrzebował jeszcze jakiegoś module bundlera typu Webpack (default) lub Browserify, który ogarnie Ci te zależności, co gdzie importujesz i sklei wszystko do kupy.