Odczytywanie wartości z pliku i przypisanie do zmiennych.

Witam, mam problem z napisaniem metody która pozwoli odczytać zapisany plik binarny i informacje w nim zawarte przekaże do odpowiednich zmiennych.

Plik wygląda następująco:
pierwsza liczba - ilość punktów
kolejna liczba - wartość współrzędnej x
kolejna liczba - wartość współrzędnej y

zapisywanie do pliku wyglada tak:

public void actSaveFile() throws IOException {
		System.out.println("open");
		jfc = new JFileChooser();
		int wynik = jfc.showSaveDialog(this);
		if(wynik == JFileChooser.SAVE_DIALOG)
			return;
		//FileWriter fw = new FileWriter(jfc.getSelectedFile());
		File fe = jfc.getSelectedFile();
		BufferedOutputStream bos = new BufferedOutputStream(new FileOutputStream(fe));
		DataOutputStream fw = new DataOutputStream(bos);
		try {
			fw.writeInt(points.size());
			//fw.write("\t");
			for (int i = 0; i < points.size(); i++) {
				//fw.writeInt(points.get(i).x + "\t" + points.get(i).y + "\t");
				fw.writeInt(points.get(i).x);
				fw.writeInt(points.get(i).y);
			}
		} catch (IOException ioe) {
			ioe.printStackTrace();
		} finally {
			fw.close();
		}
	}

odczyt:

public void actLoadFile() throws IOException {
		System.out.println("fsdfsd");
		boolean d = true;
		int index, x ,y, i;
		jfc1 = new JFileChooser();
		int wynik = jfc1.showOpenDialog(jfc1);
		if(wynik != JFileChooser.OPEN_DIALOG) {
			return;
		}
		File fr = jfc1.getSelectedFile();
		
		//System.out.println(jfc1.getSelectedFile());
		BufferedInputStream buff = new BufferedInputStream(new FileInputStream(fr));
		DataInputStream br = new DataInputStream(buff);
		String s;
		System.out.println("fdsf");
		i = 0;
		try {
			while ((s = br.readLine()) != null) {
				index = br.readInt();
				System.out.println("index: " + index);
				//br.readChar();
				points.setSize(index);
				//for(int i = 0; i < index; i++) {
					x = br.readInt(); // TUTAJ DOSTAJĘ WYJĄTEK EOFException
					System.out.println("x: " + x);
					//br.readChar();
					y = br.readInt();
					System.out.println("y: " + y);
					//br.readChar();
					points.set(i, new Point(x, y));
				//} 
				d = false;
				i++;
				//s = br.readLine();
				//System.out.println(s);
			}			
		} catch (IOException ioe) {
			ioe.printStackTrace();
		} finally {
			System.out.println(points.size());
			br.close();
			rysujPunkty();
			d = false;
		}
		
	}

kod się kompiluje, ale wywala mi wyjątek EOFException, natomiast zmienna index otrzymuje dobrą wartość

liczę, że wszystko dokładnie wyjaśniłem, pozdrawiam!

Nie rozumiem Twojego pomysłu na odczytywanie, odczytujesz wiersz do zmiennej s, ale z tej zmiennej s nie korzystasz. Więc tracisz pierwszy odczytany wiersz.
Dlaczego nie korzystasz z serializacji, ObjectOutputStream i ObjectInputStream? Wtedy zapisanie to jedno polecenie writeObject(points); podobnie będzie z odczytem.